实验动物房属于生物洁净室，但由于它本身的特点，其洁净度标准不宜直接套用美国航空航天局标准所规定的洁净室分级标准其主要原因如下:

（1）NASA《洁净室和洁净工作台微生物的控制标准》，是为宇宙飞船的制造、试验和发射环境而制定的洁净室标准。其主要目的之一是极力避免地球上的物质、微生物等混来自其他星球的采样中，以防止对其他星球是否存在某种物质或微生物的错误判断。此外还要防止从其他星球的采样中携带回的，可能危及人类地球安全的未知物质和微生物的扩散、传播。所以，该标准是比较严格的。但实际上NASA标准从发表迄今不仅被用于世界各国的宇航工业，而且还被引用于医药工业、食品工业、生物实验室以及医学等各种微生物净化领域。不过，医学界认为该标准对于某些不必严格排除非生物性微粒的使用部门增加了额外的制约，况且就对微生物粒子的控制而言，该标准也因从宇航技术的特殊角度出发，规定偏严，这对于动物体发散尘、菌集中实验动物房就不一定适用。

由于NASA标准的特殊性，实际上它不太适于用做地球上具有特定目的的微生物污染控制标准，而实验动物房内的微生物控制是具有特定目的的。实验动物房是动物生活的场所。活动的动物，即使本身很洁净，但对洁净室而言仍是最大的污染源，而且，实验动物房内的尘、菌发生量随机性大很难确定，其颗粒浓度和粒径分布也是不稳定的。实验动物房空态时能达到NASA标准的高级别，但饲养动物时却难于维持同一级别。而实验动物房的洁净度关键在于其动态，它决定于实验动物的洁净度，实验要求的洁净度及通过实验损失的洁净度。

（2）实验动物房的运行时间与其他生物洁净室的不同。其他生物洁净室，如手术室、制药厂等，其室内洁净度只要求在某一时间段内，如手术期间或生产药品时，维持其所需水平。而实验动物房的洁净度通常是昼夜地、长期连续地维持其所需水平。因此，室内不可能采用熏蒸等方式进行较彻底的灭菌处理，只能使用不致影响实验动物正常生活，而药力相对较弱的药剂擦洗。这就意味着，微生物一旦污染室内就较难控制。因此，必须全面杜绝微生物的污染，长期保证室内空气质量。

（3）除无菌动物和特殊菌动物养设施外，占洁净动物饲养设施主流的无特殊病原体动物饲养设施的洁净度要求相对较低。这主要因为:无特殊病原体的动物身上除指定病原体外，允许其他非病原性常在菌存在。而且有些常在菌是动物正常生命活动不可缺少的。因此空气净化技术只需除去有害动物健康，影响实验结果的特定微生物群。所以无特殊病原体动物的饲养设施不一定要求很高的洁净度。当指定的病原体种类越多，饲养条件相对越严格。