在食品工厂加工车间中，排水沟的卫生、清洁至关重要，如果出现严重积水、渗漏、污秽物等，往往会滋生霉菌和虫害从而造成食品的污染，导致众多产品安全问题。外部虫害、老鼠等都有可能从下水道通过车间地漏进入生产区域，所以食品工厂车间排水沟设计是车间与排水管系统相结合的重要环节，做好食品工厂车间排水沟设计刻不容缓。
食品工厂车间中水管外应在适当的位置安装真空消除器，避免水管外被污染的水被虹吸和倒流进入水管内。食品工厂车间排水沟设计应该做到排水沟表面光滑并且不渗水，可以考虑树脂沟和HDPE排水沟，也可以用瓷砖贴面，最好的是不锈钢材料，最不可取的是水泥。
食品工厂车间排水沟设计施工的同时要保证2%-3%的倾斜度最好，转弯处要做成圆弧形，避免直角弯，以确保排水畅通不积水，并且表面要光滑没有裂缝。食品工厂车间排水沟设计时注意排水的方向也是从清洁区向非清洁区排放，不同的车间要设置不同的排水沟，排水沟上边还要加上不锈钢材料制成的活动篦子。排水沟的出口处要安装防鼠网罩，车间地漏或者排水沟的出口需使用U型、P型或者S型的可以存水弯的水封，起到防虫防臭的作用。需要浸烫打毛的车间需要采取明沟，方便清除羽毛和污水中的形物。明沟应该采取浅浅的明沟，更便于冲洗、易于监控。
4、食品工厂车间排水地漏要设防固形物进入的措施
车间内的异味来源之一就是通过地漏散发到车间的各个角落。所以最理想的地漏应该带有水封，最好是带消毒剂液封，液封高度达到7厘米以上就可以防止排水沟反味，类似马桶的U型管。但是液封液位不宜过高，避免长时间不生产出现蒸发现象导致液位降低失去价值。
地漏如果长时间贮水，导致湿度过高，并且残渣较多，就是生产车间内的一个重要污染源，是微生物特别是霉菌繁殖的乐土。所以在食品工厂车间中排水沟的清洁特别重要，要控制好清洁次数，在食品工厂车间排水沟设计时都要考虑到这些方方面面。
1、每天要洗洗刷刷，清洁完成后做好消毒工作，90℃以上的开水以及漂白剂或者泡沫消毒剂，季铵盐类型的。
2、出入车间要关好门窗，下水道上边安装灭蝇灯，做好车间卫生。