生鲜食品工厂有平顶式及尖顶式两种屋顶。平顶式屋顶及天花板应使用不渗水、表面光洁、耐腐蚀、耐温、白色或浅色防水材料覆涂或装修。若喷涂涂料应使用可防霉、不易剥落且易清洗的材料。生产、包装、贮存等车间的屋顶应有适当的坡度，易于清扫、消毒，以防止灰尘蓄积，避免结露、长霉或成片剥落等情况发生。管制生产区及其他食品暴露场所（原料料理车间除外）屋顶若为容易藏污纳垢的结构，应加设平滑易清扫的天花板。天花板可以使用塑料材料制成的浅色防水材料。悬挂式天花板还应防灰及定期灭虫。屋顶若为钢筋混凝土构筑，其室内屋顶应平坦无缝隙，而梁与梁及梁与屋顶接合处应有适当的弧度，以便清洁。

蒸汽、水、电等配管不得设于暴露食品的直接上空，否则应有能防止尘埃及凝结水等掉落的装置或措施。空调风管等宜设于天花板的上方。对于楼梯或横越生产线的跨道构筑的设计，应避免造成附近食品及食品接触面、包装材料遭受污染，并应设置有安全设施。

对于楼层结构的车间，屋顶和楼盖是沿高度将建筑物分成不同层次的水平间隔，它的表面为楼面，它的底面即为下一层的顶棚。因此，楼盖应有1.5％～2％的坡度和排水明沟或地漏，以利于排水，最好是选用现浇整体式结构保证楼盖不积水、渗水。