由于制药厂净化车间尤其制剂车间有洁净度要求，在药厂设计上均考虑密闭（包括无窗厂房或有窗密闭操作的厂房）、空调等，洁净厂房的布置与构造上有很多不利于防火的因素，如工艺上经常使用有机溶剂，并且厂房内布置有大量贵重仪器设备，一旦发生火灾造成的损失极大，所以更应重视防火安全问题。

（1）空间密闭。制剂车间内部的空间封闭、围护结构气密，相当数量的无窗车间和有局部双层密封窗的空间，不可开启，保温材料和室内装饰材料大量使用高分子合成材料，火灾发生后，燃烧中会产生大量的毒气和浓烟，对于疏散和扑救极为不利。同时由于热量无处泄放，火源的热辐射经四壁反射，室内温度会迅速升高，使室内各部位材料缩短达到燃点的时间。当厂房为无窗厂房时，一旦发生火灾时不易被外界发现，故消防问题更显突出。

（2）平面布置曲折。洁净车间平面布置曲折，洁净区对外的总出入口少，增加了疏散路线上的障碍，延长了安全疏散的距离和时间，给人员疏散造成了困难。

（3）空调风管密布。若干洁净室通过风管彼此相通，火灾发生时，特别是火灾刚起尚未发现而仍继续送回风时，风管将成为火及烟的主要扩散通道。